Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms