Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NanogQ80Z64 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NanogQ80Z64 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms