Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
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