Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms