Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms