Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf139Q7TMV1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf139Q7TMV1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf139Q7TMV1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf139Q7TMV1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf139Q7TMV1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf139Q7TMV1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf139Q7TMV1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf139Q7TMV1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf139Q7TMV1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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