Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sys1Q78S06 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sys1Q78S06 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sys1Q78S06 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sys1Q78S06 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms