Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms