Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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