Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt39Q6IFX4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt39Q6IFX4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt39Q6IFX4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt39Q6IFX4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt39Q6IFX4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt39Q6IFX4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Krt39Q6IFX4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Krt39Q6IFX4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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