Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd6Q69ZL1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd6Q69ZL1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms