Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2bQ64511 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms