Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms