Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms