Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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