Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms