Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms