Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d1Q60949 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d1Q60949 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms