Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfrsf8Q60846 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf8Q60846 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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