Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms