Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Akap4Q60662 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms