Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms