Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms