Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms