Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms