Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam208bQ5DTT3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms