Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms