Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms