Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg1lQ3V384 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms