Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms