Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc110Q3V125 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc110Q3V125 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc110Q3V125 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc110Q3V125 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc110Q3V125 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc110Q3V125 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc110Q3V125 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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