Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sfi1Q3UZY0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfi1Q3UZY0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms