Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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