Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fchsd2Q3USJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fchsd2Q3USJ8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fchsd2Q3USJ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fchsd2Q3USJ8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fchsd2Q3USJ8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fchsd2Q3USJ8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fchsd2Q3USJ8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms