Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms