Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms