Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rmi2Q3UPE3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms