Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdgfl2Q3UMU9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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