Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms