Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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