Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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