Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q3U595 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U595 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U595 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U595 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U595 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U595 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U595 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms