Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms