Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms