Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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