Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms