Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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