Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Treml4Q3LRV9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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