Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms