Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms